ある日、平凡な中学生・並平ぼん(なみひら ぼん)は、偶然T・P(タイムパトロール)隊員の少女、リーム・ストリームと出会った。リームのうっかりミスでT・Pに関する記憶が消去されなかったぼんはT・Pに消されそうになってしまう。両親の出会いを妨害し、はじめから生まれないことにするというのだ。ところがぼんが歴史にかかわる存在であることが判明したため、やむなくT・Pは秘密保持のためにぼんを隊員として入隊させる。見習い隊員となったぼんは、先輩の正隊員・リームとのコンビで数々の任務を遂行する。
Upon accidentally causing the death of his friend Tetsuo, terminally average Japanese junior high student Bon Namihara witnesses Time Patrol Agent Ream Stream reverse time and resurrect Tetsuo. Owing to his forbidden knowledge, Bon is initially threatened with erasure from history, but Ream discovers that Bon will become an individual essential to the future of humanity. She invites him to join her as a Time Patrol Agent, traveling through history to save the lives of people who would otherwise have died.