学者たちによって、「近い将来、巨大天体が降り地球は様々な災害に見舞われ、恐竜が滅亡した時と同じような状態になるであろう」と予測されたことから、人類の滅亡も危ぶまれるこの事態に、各国首脳らが極秘会議を重ねた結果、「7SEED'」と呼ばれるプロジェクトが誕生した。
それは、若く健康な人間を選んで冷凍保存し、地球が災厄に襲われている間眠らせ続け、やがて人が住める状態になったとコンピューターが判断した時に自動解凍を行い放出するというものである。人類の種を災厄が過ぎ去った後の世界にも残そうという壮大な計画であった。
В недалёком будущем гигантский метеорит столкнулся с Землёй. Все живые существа были стёрты с лица планеты. Правительство предвидело такой исход и запустило проект "7 Семян". Были отобраны пять команд, в каждой из которых состояло по семь одарённых юношей и девушек. В надежде на сохранение человечества их поместили в криогенный сон. Очнувшись в незнакомом опасном мире, ребята скорбят из-за потери всех родных и близких, но скрепя сердце стараются выжить.
Ryo and Ango are banished from the community for their actions and Team Summer A's remaining members also condemn them and choose to stay. Meanwhile, Hana has survived but is lost and on her own. Ryo and Ango come across Summer B and hesitantly join their group.